Le conseil d’administration de l’Acta administre l’association et en définit les grandes orientations. Il réunit les instituts techniques agricoles ainsi que les autres membres prévus par les statuts. Il valide le programme d’activité, établit le budget, suit les comptes rendus d’activité financiers et administratifs, et représente l’Acta auprès des pouvoirs publics.

Le bureau est élu en son sein par le Conseil d’administration. Il comprend le président, trois vice-présidents, un secrétaire-trésorier et des membres choisis parmi les adhérents de l’association ayant la qualité d’Institut technique Agricole qualifié. Il veille au bon fonctionnement de l’association et accompagne la mise en œuvre de ses orientations.