L'agro-écologie constitue un défi majeur pour les agricultures ultramarines:

  • pression permanente des ravageurs due au climat tropical ; 
  • possibilité réglementaires limitées de recours à des produits phytosanitaires ;
  • coûts élevés des intrants ;
  • exiguïté des territoires, rendant les problèmes environnementaux et sanitaires plus aigüs encore qu'en métropole.